17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1880 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1370    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  44.03 
 
 		 647 aa  178  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  49.37 
 
 		 735 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  49.37 
 
 		 735 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  33.11 
 
 		 908 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  50.75 
 
 		 957 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  64.1 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0660  hypothetical protein  26.95 
 
 		 990 aa  58.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  34.41 
 
 		 820 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  34.21 
 
 		 668 aa  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  39.51 
 
 		 783 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3346  hypothetical protein  25.56 
 
 		 682 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677729  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  33.78 
 
 		 671 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1606  hypothetical protein  36.76 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  30.71 
 
 		 851 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  54.29 
 
 		 717 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  36.36 
 
 		 1122 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>