40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3708 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 820 aa  1569    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  57.86 
 
 		 691 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  50.14 
 
 		 1673 aa  303  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  50.14 
 
 		 1668 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  55.97 
 
 		 1632 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  43.77 
 
 		 813 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  41.3 
 
 		 814 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  52.43 
 
 		 419 aa  191  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  37.85 
 
 		 853 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  45.92 
 
 		 1023 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  32.04 
 
 		 717 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  43.78 
 
 		 1115 aa  115  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1006 aa  92.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1056 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  43.4 
 
 		 1644 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  58.33 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  43.37 
 
 		 1451 aa  60.8  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  34.41 
 
 		 1222 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  34.51 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  33.71 
 
 		 698 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  27.85 
 
 		 794 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  35.05 
 
 		 908 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  31.97 
 
 		 1161 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  34.55 
 
 		 611 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.36 
 
 		 188 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  32.93 
 
 		 1063 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1366 aa  52.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1354 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  39.51 
 
 		 1122 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.36 
 
 		 196 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  34.36 
 
 		 197 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  34.55 
 
 		 647 aa  50.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  29.27 
 
 		 924 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  34.58 
 
 		 914 aa  49.3  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  25.97 
 
 		 925 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  43.08 
 
 		 957 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  35 
 
 		 1104 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  31.15 
 
 		 1028 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0660  hypothetical protein  30.3 
 
 		 990 aa  44.3  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  46 
 
 		 1380 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>