20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2994 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1426    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  31.33 
 
 		 1668 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  30.92 
 
 		 1673 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  32.04 
 
 		 820 aa  147  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  34.38 
 
 		 691 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  32.2 
 
 		 853 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  35.71 
 
 		 813 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1632 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  29.92 
 
 		 814 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  32.61 
 
 		 1023 aa  91.3  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  30.17 
 
 		 668 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  32.07 
 
 		 671 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  50 
 
 		 957 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  35.42 
 
 		 1092 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  23.17 
 
 		 1451 aa  53.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  31.09 
 
 		 735 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  31.09 
 
 		 735 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0926  hypothetical protein  50 
 
 		 627 aa  48.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  24.55 
 
 		 824 aa  47.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  54.29 
 
 		 698 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>