16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0634 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1348    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  43.56 
 
 		 1668 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  43.56 
 
 		 1673 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  48.32 
 
 		 820 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  49.85 
 
 		 1632 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  42.96 
 
 		 813 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  50.95 
 
 		 814 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  37.79 
 
 		 853 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  42.93 
 
 		 1023 aa  158  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  32.6 
 
 		 717 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  31.75 
 
 		 1451 aa  86.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  53.85 
 
 		 668 aa  69.3  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  55.38 
 
 		 671 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  42.42 
 
 		 957 aa  68.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  24.47 
 
 		 715 aa  62  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  51.11 
 
 		 671 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>