34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1349 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 853 aa  1712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  49.19 
 
 		 814 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  38.44 
 
 		 813 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  42.71 
 
 		 1632 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  45.71 
 
 		 1668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  47.75 
 
 		 1673 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  43.3 
 
 		 691 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  38.66 
 
 		 820 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  39.68 
 
 		 1023 aa  170  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 717 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  30.26 
 
 		 1075 aa  108  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  34.97 
 
 		 908 aa  108  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  32.34 
 
 		 1222 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  26.2 
 
 		 1122 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  24.68 
 
 		 1080 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  24.26 
 
 		 1080 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  24.26 
 
 		 1080 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  26.97 
 
 		 1080 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  34.38 
 
 		 914 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  27.16 
 
 		 1021 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  27.45 
 
 		 671 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  24.7 
 
 		 1104 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  26.2 
 
 		 1095 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  26.4 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  26.4 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  25 
 
 		 970 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  26.32 
 
 		 1063 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  27.27 
 
 		 1028 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  27.27 
 
 		 1028 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  27.27 
 
 		 1028 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  27.23 
 
 		 669 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  25 
 
 		 1251 aa  45.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  19.33 
 
 		 715 aa  44.3  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  22.03 
 
 		 756 aa  44.3  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>