24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1577 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 813 aa  1634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  63.45 
 
 		 814 aa  888    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  38.56 
 
 		 853 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  46.56 
 
 		 1023 aa  218  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  47.64 
 
 		 1668 aa  214  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  47.22 
 
 		 1673 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  48 
 
 		 1632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  47.9 
 
 		 820 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  47.83 
 
 		 691 aa  194  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  35.71 
 
 		 717 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  34.59 
 
 		 908 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  32.34 
 
 		 1222 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  28.65 
 
 		 1075 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  23.57 
 
 		 1080 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  23.57 
 
 		 1080 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  25.95 
 
 		 1122 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  24.29 
 
 		 1080 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  24.29 
 
 		 1080 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  27.05 
 
 		 1021 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  24.67 
 
 		 914 aa  57.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  24.61 
 
 		 671 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  22.81 
 
 		 925 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  26.14 
 
 		 1031 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  26.14 
 
 		 1031 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>