33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1626 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  100 
 
 		 925 aa  1797    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  31.47 
 
 		 824 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  25 
 
 		 590 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2014  hypothetical protein  29.44 
 
 		 510 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  21.34 
 
 		 762 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  31.3 
 
 		 719 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  29.94 
 
 		 1216 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  25.82 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  24.53 
 
 		 756 aa  65.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  26.45 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  27.23 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  26.65 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  26.67 
 
 		 1668 aa  59.7  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  32.8 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  21.49 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  26.36 
 
 		 784 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  26.36 
 
 		 784 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  32.2 
 
 		 877 aa  55.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  25.45 
 
 		 1673 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  22.59 
 
 		 814 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  22.81 
 
 		 813 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  31.58 
 
 		 550 aa  51.6  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1632 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  27.64 
 
 		 651 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  37.74 
 
 		 701 aa  47.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  24.79 
 
 		 820 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  25.5 
 
 		 642 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  31.63 
 
 		 641 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  27.16 
 
 		 738 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  30.77 
 
 		 642 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  30.53 
 
 		 680 aa  45.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  28.44 
 
 		 877 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.73 
 
 		 817 aa  44.3  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>