45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0222 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  100 
 
 
738 aa  1472    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  35.27 
 
 
680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  29.57 
 
 
739 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  29.57 
 
 
739 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  36.62 
 
 
781 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  28.44 
 
 
739 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  35.2 
 
 
642 aa  174  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  35.2 
 
 
642 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  35.2 
 
 
641 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  33.14 
 
 
793 aa  171  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  30.15 
 
 
651 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  29.51 
 
 
956 aa  153  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.58 
 
 
719 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  25.68 
 
 
714 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  29.02 
 
 
997 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  25.28 
 
 
935 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  25.28 
 
 
935 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.02 
 
 
1092 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.47 
 
 
1628 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.8 
 
 
1095 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  24.71 
 
 
1025 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  24.84 
 
 
1025 aa  107  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.5 
 
 
1342 aa  102  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  24.51 
 
 
1025 aa  99.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  22.74 
 
 
550 aa  87  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.09 
 
 
762 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  22.81 
 
 
2066 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  22.81 
 
 
2066 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  32.65 
 
 
596 aa  60.1  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.26 
 
 
784 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3592  TP901 family phage tail tape measure protein  25.4 
 
 
1426 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0797  TP901 family phage tail tape measure protein  25.4 
 
 
1426 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.274443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  23.56 
 
 
784 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  28.75 
 
 
590 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  19.79 
 
 
1216 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  23.26 
 
 
784 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3243  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.95 
 
 
1419 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.948991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  21.27 
 
 
781 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  26.36 
 
 
919 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  25.85 
 
 
887 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  29.47 
 
 
920 aa  51.6  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.83 
 
 
733 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  20.82 
 
 
743 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  24.66 
 
 
655 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  24.31 
 
 
921 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>