81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1914 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  100 
 
 		 887 aa  1778    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  42.67 
 
 		 920 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  42.55 
 
 		 919 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  36.96 
 
 		 986 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  40.74 
 
 		 877 aa  203  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  33.33 
 
 		 784 aa  173  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  33.51 
 
 		 784 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  33.33 
 
 		 784 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  33.22 
 
 		 1216 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  32.14 
 
 		 863 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  35.19 
 
 		 1078 aa  135  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  40.45 
 
 		 817 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  37.57 
 
 		 809 aa  120  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  40.59 
 
 		 813 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  41.28 
 
 		 935 aa  118  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  40.38 
 
 		 935 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  33.06 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.04 
 
 		 815 aa  111  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  36.82 
 
 		 956 aa  111  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.07 
 
 		 825 aa  108  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  35.58 
 
 		 877 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  34.59 
 
 		 361 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1491  hypothetical protein  25.47 
 
 		 768 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  35.78 
 
 		 971 aa  100  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  35.78 
 
 		 971 aa  101  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2478  hypothetical protein  25.74 
 
 		 642 aa  96.3  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  35.96 
 
 		 1025 aa  93.2  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  36.06 
 
 		 1025 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  26.85 
 
 		 550 aa  89.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.14 
 
 		 959 aa  87.8  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  37.93 
 
 		 993 aa  87.8  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6588  hypothetical protein  26.58 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  34.62 
 
 		 1025 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  35.42 
 
 		 739 aa  82  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  35.29 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  35.29 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  27.78 
 
 		 824 aa  78.2  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2296  hypothetical protein  25.51 
 
 		 613 aa  76.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  37.42 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  34.86 
 
 		 1183 aa  68.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  30.77 
 
 		 1183 aa  68.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  30.77 
 
 		 1183 aa  68.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1088 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  39.47 
 
 		 1084 aa  65.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  30.77 
 
 		 762 aa  65.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  28.45 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  28.85 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  33.03 
 
 		 1183 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.35 
 
 		 760 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.72 
 
 		 1032 aa  61.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  41.9 
 
 		 590 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  25.41 
 
 		 1137 aa  60.1  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  42.42 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  25.37 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  33.77 
 
 		 693 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  36.9 
 
 		 1155 aa  55.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  36.9 
 
 		 1155 aa  55.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  25.11 
 
 		 714 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.73 
 
 		 823 aa  55.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1089 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.25 
 
 		 719 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  25.9 
 
 		 738 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  29.25 
 
 		 759 aa  51.2  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  44.12 
 
 		 1136 aa  51.2  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  44.12 
 
 		 1136 aa  51.2  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  32.5 
 
 		 852 aa  51.6  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.18 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  23.41 
 
 		 877 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  29.3 
 
 		 666 aa  49.3  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  28.34 
 
 		 945 aa  48.9  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1952  hypothetical protein  29.61 
 
 		 697 aa  49.3  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  28.34 
 
 		 945 aa  48.9  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2014  hypothetical protein  38.98 
 
 		 510 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  25.59 
 
 		 1995 aa  48.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  27.04 
 
 		 818 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  27.1 
 
 		 1030 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  26.07 
 
 		 647 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  32.53 
 
 		 786 aa  45.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  31.25 
 
 		 806 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  32.53 
 
 		 871 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  22.69 
 
 		 781 aa  44.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>