77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4860 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  91.21 
 
 
919 aa  1656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  100 
 
 
920 aa  1849    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  50.5 
 
 
986 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  42.54 
 
 
887 aa  635  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  43.28 
 
 
1078 aa  241  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.75 
 
 
877 aa  159  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  40.94 
 
 
863 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  33.44 
 
 
1216 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  33.97 
 
 
956 aa  134  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  22.88 
 
 
877 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  40.15 
 
 
1032 aa  107  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.71 
 
 
959 aa  104  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6588  hypothetical protein  26.22 
 
 
668 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  38.56 
 
 
971 aa  102  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  38.56 
 
 
971 aa  102  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  37.07 
 
 
809 aa  98.2  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  28.9 
 
 
935 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1491  hypothetical protein  25 
 
 
768 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  28.9 
 
 
935 aa  94.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  28.57 
 
 
1025 aa  94  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  28.71 
 
 
1025 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  39.49 
 
 
813 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  25.22 
 
 
1088 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  33.01 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  29.75 
 
 
784 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.45 
 
 
823 aa  85.5  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.75 
 
 
815 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2478  hypothetical protein  24.23 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  29.15 
 
 
784 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27.9 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  32.37 
 
 
945 aa  81.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  32.37 
 
 
945 aa  81.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  43.3 
 
 
459 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  28.9 
 
 
1025 aa  79  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  31.25 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  20.39 
 
 
760 aa  75.5  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  29.78 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  29.06 
 
 
739 aa  74.7  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  29.06 
 
 
739 aa  74.7  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.62 
 
 
817 aa  72.8  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2296  hypothetical protein  23.38 
 
 
613 aa  68.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  27.62 
 
 
739 aa  67.4  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  29.34 
 
 
737 aa  65.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  27.01 
 
 
680 aa  65.1  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.01 
 
 
825 aa  62  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  25.9 
 
 
596 aa  60.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  39.74 
 
 
1137 aa  60.1  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25 
 
 
719 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  30.18 
 
 
993 aa  56.6  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  36.36 
 
 
590 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  32.65 
 
 
824 aa  54.7  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  25.93 
 
 
701 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  35.24 
 
 
1084 aa  54.3  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  39.62 
 
 
775 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  35.24 
 
 
1089 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  27.5 
 
 
759 aa  52  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  35.29 
 
 
1136 aa  52  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  35.29 
 
 
1136 aa  52  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  29.59 
 
 
738 aa  51.6  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  25 
 
 
590 aa  51.6  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  33.86 
 
 
858 aa  51.2  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  23.31 
 
 
781 aa  50.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.9 
 
 
743 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  28.38 
 
 
693 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  20.73 
 
 
997 aa  48.5  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3667  hypothetical protein  52.94 
 
 
191 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  28.95 
 
 
1183 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  27.19 
 
 
1183 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  27.19 
 
 
1183 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  28.95 
 
 
1183 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  28.07 
 
 
1183 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  26.09 
 
 
762 aa  46.2  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  27.54 
 
 
902 aa  45.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  22.7 
 
 
582 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  22.94 
 
 
714 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  29.89 
 
 
1155 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  29.89 
 
 
1155 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>