69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2882 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1183 aa  2341    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  94.34 
 
 		 1183 aa  2179    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  94.17 
 
 		 1183 aa  2175    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  93.66 
 
 		 1183 aa  2152    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  92.65 
 
 		 1183 aa  2135    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  94.76 
 
 		 1183 aa  2194    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  94 
 
 		 1183 aa  2180    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  27.82 
 
 		 1549 aa  179  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  25.69 
 
 		 1178 aa  157  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.51 
 
 		 877 aa  152  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  23.69 
 
 		 2066 aa  140  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  31.85 
 
 		 914 aa  140  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  23.69 
 
 		 2066 aa  140  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  29.56 
 
 		 733 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  26.92 
 
 		 815 aa  134  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  27.02 
 
 		 809 aa  134  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.74 
 
 		 815 aa  131  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  25.46 
 
 		 1346 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  24.41 
 
 		 1283 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  29.38 
 
 		 1216 aa  118  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  26.09 
 
 		 971 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  32.66 
 
 		 975 aa  113  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.65 
 
 		 1173 aa  103  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  31.73 
 
 		 1297 aa  102  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  24.57 
 
 		 971 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.25 
 
 		 1371 aa  99  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  30.47 
 
 		 959 aa  99  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  30.47 
 
 		 959 aa  99  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  30.19 
 
 		 1671 aa  95.9  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  30.94 
 
 		 813 aa  94.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.99 
 
 		 1343 aa  89  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.37 
 
 		 981 aa  88.6  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  28.19 
 
 		 757 aa  84.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  26.18 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.54 
 
 		 1478 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  28.39 
 
 		 969 aa  80.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  27.42 
 
 		 1409 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  32.03 
 
 		 863 aa  69.7  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  34.04 
 
 		 1030 aa  70.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  34.86 
 
 		 887 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  33.53 
 
 		 956 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  22 
 
 		 987 aa  62.4  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  32.14 
 
 		 935 aa  62  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  32.14 
 
 		 935 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  30 
 
 		 936 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  29.58 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2149  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.94 
 
 		 959 aa  59.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  23.78 
 
 		 735 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.17 
 
 		 936 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  24.77 
 
 		 945 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  24.77 
 
 		 945 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  29.79 
 
 		 459 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  27.35 
 
 		 858 aa  50.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  28.67 
 
 		 921 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  29.85 
 
 		 814 aa  50.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.25 
 
 		 1245 aa  48.5  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  26.72 
 
 		 919 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  28.16 
 
 		 1318 aa  47  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  27.88 
 
 		 986 aa  47.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3487  hypothetical protein  24.05 
 
 		 636 aa  46.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.186472  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  28.07 
 
 		 920 aa  46.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  28.71 
 
 		 853 aa  45.8  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  28.71 
 
 		 853 aa  45.8  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  28.71 
 
 		 849 aa  45.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  28.64 
 
 		 853 aa  45.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2103  phage tape measure protein  38.1 
 
 		 1307 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.56214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  39.22 
 
 		 1736 aa  45.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.93 
 
 		 760 aa  44.7  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>