58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0884 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 823 aa  1641    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  34.02 
 
 		 814 aa  277  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  25.58 
 
 		 781 aa  183  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.47 
 
 		 950 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.93 
 
 		 743 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  26.56 
 
 		 993 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.82 
 
 		 817 aa  124  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.13 
 
 		 825 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  23.5 
 
 		 784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  24.08 
 
 		 956 aa  115  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.97 
 
 		 784 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  23.21 
 
 		 784 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  29.43 
 
 		 599 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  28.52 
 
 		 919 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1528  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.5 
 
 		 625 aa  97.8  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  23.9 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  28.33 
 
 		 920 aa  95.5  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  24.84 
 
 		 739 aa  94.7  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  24.84 
 
 		 739 aa  94.7  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  23.74 
 
 		 666 aa  94.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  34.93 
 
 		 1025 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  35.21 
 
 		 959 aa  87.8  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  34.45 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  29.95 
 
 		 1025 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  34.45 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  23.17 
 
 		 916 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  24.06 
 
 		 1314 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  36.84 
 
 		 809 aa  84.3  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  25.13 
 
 		 814 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  23.02 
 
 		 1089 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  27.16 
 
 		 935 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  27.05 
 
 		 935 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  31.01 
 
 		 1078 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  29.86 
 
 		 1025 aa  79.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  37.69 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.69 
 
 		 815 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  36.03 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1557  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.3 
 
 		 722 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  30.32 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.51 
 
 		 1032 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.78 
 
 		 719 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  23.81 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  31.54 
 
 		 813 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  25.4 
 
 		 735 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  24.15 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  22.54 
 
 		 824 aa  62  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0743  hypothetical protein  29.17 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  28.25 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  27 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  26.72 
 
 		 986 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  23.13 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  25 
 
 		 714 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  29.34 
 
 		 902 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  23.67 
 
 		 877 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  21.64 
 
 		 680 aa  46.2  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  25.26 
 
 		 1030 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  23.15 
 
 		 651 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  20.58 
 
 		 1120 aa  45.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>