57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1146 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  100 
 
 
1137 aa  2254    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  29.78 
 
 
726 aa  180  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  29.71 
 
 
811 aa  179  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  29.71 
 
 
811 aa  179  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  32.62 
 
 
725 aa  178  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  30.48 
 
 
716 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  26.41 
 
 
874 aa  130  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  32.48 
 
 
907 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  28.23 
 
 
1297 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  24.32 
 
 
959 aa  114  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  24.86 
 
 
1155 aa  98.2  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  24.86 
 
 
1155 aa  98.2  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  22.34 
 
 
871 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  20.96 
 
 
1084 aa  94.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  27.45 
 
 
759 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  29.44 
 
 
1216 aa  93.2  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  26.92 
 
 
877 aa  91.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  22.56 
 
 
786 aa  88.2  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  25.19 
 
 
807 aa  86.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  24.37 
 
 
1347 aa  86.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  23.14 
 
 
1510 aa  84.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  23.14 
 
 
1510 aa  84.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  22.13 
 
 
1077 aa  84.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  24.31 
 
 
989 aa  84  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  24.31 
 
 
989 aa  84  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  24.44 
 
 
1347 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  21.46 
 
 
1206 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  18.01 
 
 
805 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  22.57 
 
 
737 aa  71.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  24.63 
 
 
1136 aa  70.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  24.63 
 
 
1136 aa  70.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.37 
 
 
805 aa  70.1  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  24 
 
 
911 aa  69.3  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  19.53 
 
 
721 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  21 
 
 
762 aa  65.1  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  21.84 
 
 
318 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  39.74 
 
 
920 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  25.41 
 
 
887 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  26.86 
 
 
1216 aa  58.5  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  40 
 
 
919 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  19.41 
 
 
852 aa  57  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  22.34 
 
 
956 aa  57  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  39.24 
 
 
986 aa  56.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  22.04 
 
 
975 aa  55.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  21.79 
 
 
806 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  22.62 
 
 
792 aa  54.3  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  21.26 
 
 
590 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  22.5 
 
 
767 aa  52.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.9 
 
 
877 aa  50.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  25.19 
 
 
1246 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  23.14 
 
 
841 aa  50.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  23.14 
 
 
841 aa  50.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  23.46 
 
 
759 aa  49.7  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  20.98 
 
 
1442 aa  49.3  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0762  hypothetical protein  24.81 
 
 
353 aa  48.5  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  21.43 
 
 
1566 aa  48.9  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1357  pseudouridine synthase  36.27 
 
 
369 aa  45.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>