46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1618 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  100 
 
 		 762 aa  1502    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  39.21 
 
 		 818 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  38.43 
 
 		 852 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  37.29 
 
 		 806 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  29.16 
 
 		 871 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  28.21 
 
 		 786 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  34.72 
 
 		 756 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  34.34 
 
 		 647 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  24.12 
 
 		 759 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  31.22 
 
 		 671 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0596  prophage LambdaSa1, pblA protein, internal deletion  22.64 
 
 		 670 aa  87.4  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  26.5 
 
 		 824 aa  87  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 715 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  24.6 
 
 		 1084 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  20.95 
 
 		 925 aa  75.1  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  28.9 
 
 		 828 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  21 
 
 		 1137 aa  64.7  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  26.42 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  31.78 
 
 		 887 aa  62  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1089 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  21.74 
 
 		 1297 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  27.7 
 
 		 1510 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  27.7 
 
 		 1510 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  22.85 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  26.9 
 
 		 1283 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  21.07 
 
 		 1155 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  23.89 
 
 		 1346 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  21.07 
 
 		 1155 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  22.83 
 
 		 989 aa  52.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  22.83 
 
 		 989 aa  52.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3494  hypothetical protein  26.94 
 
 		 852 aa  51.2  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0571399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  23.92 
 
 		 1995 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  29.23 
 
 		 701 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  16.97 
 
 		 811 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  16.67 
 
 		 726 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  16.97 
 
 		 811 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  34.62 
 
 		 993 aa  50.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  27.31 
 
 		 623 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  26.2 
 
 		 759 aa  48.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2014  hypothetical protein  25.77 
 
 		 510 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979854  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  22.06 
 
 		 737 aa  46.6  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  17.05 
 
 		 725 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  26.09 
 
 		 920 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  27 
 
 		 794 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.48 
 
 		 1671 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  22.48 
 
 		 841 aa  43.9  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>