Gene SaurJH1_0919 details

Gene Information

• Locus tag: SaurJH1_0919
• ID: 5316505
• Type: CDS
• Is gene spliced: No
• Is pseudo gene: No
• Organism name: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1
• Kingdom: Bacteria
• Replicon accession: NC_009632
• Strand: +
• Start bp: 946053
• End bp: 949520
• Gene Length: 3468 bp
• Protein Length: 1155 aa
• Translation table: 11
• GC content: 35%
• IMG OID: 640779006
• Product: phage tape measure protein
• Protein accession: YP_001316062
• Protein GI: 150393387
• COG category: [S] Function unknown
• COG ID: [COG5412] Phage-related protein

Plasmid Coverage information

• Num covering plasmid clones: 6
• Plasmid unclonability p-value: 1
• Plasmid hitchhiking: No
• Plasmid clonability: normal

Fosmid Coverage information

• Num covering fosmid clones: n/a
• Fosmid unclonability p-value: n/a
• Fosmid Hitchhiker: n/a
• Fosmid clonability: n/a

Sequence

Gene sequence

GTGACGGAAT ATAAAATTAA AGCGACTATT GAAGCTAGTG TAGCCAAATT CAAAAGGCAA 
ATTGATAGTG CGGTTAAGTC TGTGCAAAGA TTTAAACGAG TAGCAGATCA AACTAAAGAT 
GTTGAATTAA ACGCTAACGA TAAAAAATTA CAAAAAACTA TCAAGGTTGC TAAAAAGTCT 
TTAGATGCCT TTAGCAACAA AAATGTAAAA GCTAAATTAG ATGCTAGTAT ACAAGACTTA 
CAACAAAAGA TATTAGAATC AAATTTTGAA CTAGACAAAC TTAACTCCAA AGAAGCTAGC 
CCTGAGGTTA AACTACAAAA ACAAAAGTTA ACTAAAGATA TCGCTGAAGC AGAAGTTAAG 
TTATCCGAAC TAGAAAAGAA GCGTATCAGT ATTGACGTCA ATGCAGATAA CAGTAAATTC 
AATCGAGTGT TAAAAGTATC TAAAGCTAGT CTTGAAGCAT TAAATAGGTC TAAAGCCAAA 
GCTATTATAG ACGTGGACAA TGGTGTTGCT AACTCTAAAA TAAAACGCAC TAAAGAAGAG 
CTTAAAAGTA TTCCAAACAA AACTAGATCT CGACTAGATG TAGATACAGG GCTTTCTATA 
CCAACTATTT ATGCGTTTAA AAAATCATTA GACGCATTGC CGAACAAAAA AACAACAAAG 
GTAGATGTCG ATACTAATGG TTTAAAGAAA GCTTATGCCT ACATAATAAA AGCAAACGAC 
AATTTCCAAA GACAGATGGG GAATTTAGCT AATATGTTCC GTGTGTTCGG TACTGTAGGT 
TCTAATATGG TTGGTGGATT ACTAACTTCA TCTTTTAGTA TCTTAATACC TGTAATAGCG 
AGCGTAGTAC CTGTAGTATT TGCGCTATTA AACGCTATCA AAGTGTTAAC TGGCGGTGTA 
CTTGCTTTAG GTGGTGCGGT AGCAATAGCC GGCGCTGGCT TTGTAGCATT TGGCGCAATG 
GCTATCAGCG CTATAAAGAT GCTTAGTGAC GGCACTTTAC AAGCTAGCTC AGCAACAAAC 
GAATACAAAA AAGCTTTAGA TGGCGTAAAG TCAGCATGGA CTGATATTAT AAAGCAAAAT 
CAATCCGCTA TATTCACAAC TCTTGCAAAC GGTTTAAATA CTGTTAAAAC AGCAATGCAG 
AGCTTACAAC CTTTTTTTAG TGGTATTTCA AGAGGAATGG AAGAGGCGTC TCAAAGTGTG 
TTTAAATGGG CTCAAAATAG CGGTGTAGCA TCAAGGTTCT TCAACATGAT GAATACAACT 
GGTGTTTCGG TATTTAACAA GCTATTAAGT GCTGCAGGCG GTTTCGGTGA TGGATTAGTC 
AATGTATTCA CACAATTAGC ACCACTGTTT CAATGGTCGG CTGATTGGTT GGATAGATTA 
GGTCAATCTT TCTCTAACTG GGCTAATAGT GCAGCTGGAG AAAATTCGAT AACTCGTTTT 
ATTGAATACA CAAAAACAAA CTTACCTATC ATTGGTAATA TTTTTAAAAA TGTTTTCGTT 
GGAATTAACA ATTTGATGAA TGCATTCAGT GGATCATCAA CTGGCATTTT CCAATCTCTT 
GAACAAATGA CAGCTAAGTT TAGGGAATGG TCTGAACAAG TAGGACAATC TCAAGGGTTT 
AAAGACTTTG TCAGTTATAT ACAAACTAAT GGACCACTAA TAATGCAATT AATTGGGAAC 
ATTGCAAGAG GATTAGTTGC ATTCGCAACA GCGATGGCTC CTATAGCTAG TGCAGTATTA 
CGCGTTGCAG TAGCAATAAC TGGTTGGATA GCTAACTTGT TTGAGGCGCA TCCAGCTACA 
GCACAATTAG TTGGTGTCAT TATAACTTTA GTTGGTGCAT TTAGATTTTT AATACCGATT 
ATTCTTGCTG TATCTAACTT TATGGGTGGC GGATTAATAG GTAGAATCAT TGCGTTAGTA 
AGTAAGTTCG GTTTATTAAG AGCGGGATTA ACAATTTTAA AAGGTGCGTT CATGTTATTA 
AAAGGACCAT TAAAAATTAT ATCAGTTATA TTCCAATTGT TATTCGGTAA GATTGGATTA 
ATTAGAAATG CTATCACAGG ACTAGTAACT GTGTTTGGTA TTTTAGGTGG TCCAATAACA 
ATAGTTATCG GTGTAATCGC TGCATTAATA GCTATATTCG TTTTATTGTG GAATAAAAAT 
GAAGGATTCA GAAACTTTAT TATAAATGCT TGGAATGCGA TAAAAACGTT TATGGTTACA 
GTTTGGAATG TGTTGAAAAC TGTAGCTTCG GTTGTATGGA ATGCTATTTT AAAAGCTATC 
ACTACAGCAG TAACTAATGT ATACAATTTT ATAATGATTG TTTGGAATCA AATAGCCGCT 
TATTTACAAG GGTTATGGAA TGGAATTATC GCTATTGCAA CAACGGTATG GAACCTTTTA 
GTTACAATCA TCACAACTGT TTTCACGACG ATAATGACAA TAGTTATGAC GATATGGACA 
GCTATTTGGA CATTCTTAAG TACAATCTGG AACACGATAA TTACAATCGC TACTACGATT 
TGGAATTTGT TAGTCACTGT AATAACTACA GTATTTACCA CAATTATGAC TATCGCAATG 
ACAATTTGGA ACGCTATTTG GACGTTCTTA CAAACGTTGT GGAACACTAT AGTTACTGTG 
GCAACTAAGG TTTGGAACGC TATCACTACA ACTATATCTA CTGCGTTACA AGCGGCATGG 
AGTTTTATTT CTAATATATG GAATACGATT TGGAGTTTCT TATCTGGTAT ATTAACGACA 
ATTTGGAATA AAGTTGTAAG CATATTCACA CAAGTTGTAT CAACTATATC AGACAAAATG 
TCTCAAGCTT GGAACTTCAT CGTGACTAAA GGTATGCAAT GGGTATCTAC TATAACAAGT 
ACGCTAATTA ACTTTGTTAA TAGAGTTATT CAAGGATTCG TTAATGTTGT AAACAAAGTT 
AGTCAAGGTA TGACAAATGC AGTAAATAAA ATAAAAAGCT TTATAGGAGA TTTTGTGTCT 
GCAGGTGCTG ATATGATCCG TGGTTTAATT AGAGGTATTG GACAAATGGC TGGCCAATTA 
GTAGATGCGG CTAAAAATGT TGCTAAGAAA GCTTTAGATG CAGCTAAAAG TGCTTTGGGT 
ATTCACTCAC CTTCACGTGA ATTCATGGAT GTTGGTGTGT ATTCAATGCT AGGTTTCGTT 
AAAGGTATAG ATAATCATTC AAGTAAAGTT ATCCGTAATG TTTCTAATGT TGCAGATAAA 
GTAGTTGATG CATTTCAACC TACATTAAAC GCACCTGACA TTTCTAGTAT TACAGGAAAC 
TTAAGTAATT TAGGTGGAAA TATAAATGCG CAAGTACAAC ACACACATTC TATTGAAACA 
TCACCGAACA TGAAAACTGT TAAAGTTGAA TTCGATGTCA ATAACGATGC GCTTACTAGT 
ATTGTTAACG GCAGAAATGC TAAACGCAAT TCTGAGTATT ACTTATAA 

 

Protein sequence

MTEYKIKATI EASVAKFKRQ IDSAVKSVQR FKRVADQTKD VELNANDKKL QKTIKVAKKS 
LDAFSNKNVK AKLDASIQDL QQKILESNFE LDKLNSKEAS PEVKLQKQKL TKDIAEAEVK 
LSELEKKRIS IDVNADNSKF NRVLKVSKAS LEALNRSKAK AIIDVDNGVA NSKIKRTKEE 
LKSIPNKTRS RLDVDTGLSI PTIYAFKKSL DALPNKKTTK VDVDTNGLKK AYAYIIKAND 
NFQRQMGNLA NMFRVFGTVG SNMVGGLLTS SFSILIPVIA SVVPVVFALL NAIKVLTGGV 
LALGGAVAIA GAGFVAFGAM AISAIKMLSD GTLQASSATN EYKKALDGVK SAWTDIIKQN 
QSAIFTTLAN GLNTVKTAMQ SLQPFFSGIS RGMEEASQSV FKWAQNSGVA SRFFNMMNTT 
GVSVFNKLLS AAGGFGDGLV NVFTQLAPLF QWSADWLDRL GQSFSNWANS AAGENSITRF 
IEYTKTNLPI IGNIFKNVFV GINNLMNAFS GSSTGIFQSL EQMTAKFREW SEQVGQSQGF 
KDFVSYIQTN GPLIMQLIGN IARGLVAFAT AMAPIASAVL RVAVAITGWI ANLFEAHPAT 
AQLVGVIITL VGAFRFLIPI ILAVSNFMGG GLIGRIIALV SKFGLLRAGL TILKGAFMLL 
KGPLKIISVI FQLLFGKIGL IRNAITGLVT VFGILGGPIT IVIGVIAALI AIFVLLWNKN 
EGFRNFIINA WNAIKTFMVT VWNVLKTVAS VVWNAILKAI TTAVTNVYNF IMIVWNQIAA 
YLQGLWNGII AIATTVWNLL VTIITTVFTT IMTIVMTIWT AIWTFLSTIW NTIITIATTI 
WNLLVTVITT VFTTIMTIAM TIWNAIWTFL QTLWNTIVTV ATKVWNAITT TISTALQAAW 
SFISNIWNTI WSFLSGILTT IWNKVVSIFT QVVSTISDKM SQAWNFIVTK GMQWVSTITS 
TLINFVNRVI QGFVNVVNKV SQGMTNAVNK IKSFIGDFVS AGADMIRGLI RGIGQMAGQL 
VDAAKNVAKK ALDAAKSALG IHSPSREFMD VGVYSMLGFV KGIDNHSSKV IRNVSNVADK 
VVDAFQPTLN APDISSITGN LSNLGGNINA QVQHTHSIET SPNMKTVKVE FDVNNDALTS 
IVNGRNAKRN SEYYL