50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0919 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  100 
 
 
1155 aa  2284    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  100 
 
 
1155 aa  2284    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  36.48 
 
 
989 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  36.48 
 
 
989 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  32.29 
 
 
907 aa  141  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  24.59 
 
 
726 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  28.21 
 
 
1137 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  23.13 
 
 
811 aa  118  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  23.13 
 
 
811 aa  118  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  23.76 
 
 
725 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  28.04 
 
 
716 aa  108  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  22.16 
 
 
1995 aa  99  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  22.01 
 
 
1206 aa  98.2  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  24.88 
 
 
1510 aa  95.1  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  24.88 
 
 
1510 aa  95.1  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  24.65 
 
 
911 aa  92.8  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  27.25 
 
 
1297 aa  92.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  27.15 
 
 
759 aa  89  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  20.58 
 
 
721 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  23.55 
 
 
959 aa  86.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  24.63 
 
 
877 aa  84  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  20.43 
 
 
805 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  23.48 
 
 
871 aa  81.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  22.47 
 
 
786 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  21.56 
 
 
874 aa  75.1  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.68 
 
 
805 aa  73.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  22.09 
 
 
1216 aa  70.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  35.26 
 
 
1136 aa  70.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  35.26 
 
 
1136 aa  70.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  21.85 
 
 
1089 aa  69.7  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  25.48 
 
 
956 aa  68.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  20.54 
 
 
1077 aa  66.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  20.55 
 
 
762 aa  65.1  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  21.7 
 
 
1347 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  21.13 
 
 
1347 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  36.9 
 
 
887 aa  55.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  26.82 
 
 
1311 aa  55.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  26.82 
 
 
1311 aa  55.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  21.92 
 
 
852 aa  55.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  20.37 
 
 
806 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.53 
 
 
719 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  24.9 
 
 
737 aa  52  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  23.89 
 
 
1566 aa  50.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  24.18 
 
 
714 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  20.47 
 
 
975 aa  48.9  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  32.29 
 
 
986 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  38.71 
 
 
693 aa  47.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  19.47 
 
 
792 aa  46.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1952  hypothetical protein  25.58 
 
 
697 aa  45.8  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  23.11 
 
 
920 aa  45.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>