30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1298 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  75.47 
 
 		 582 aa  838    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 590 aa  1180    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1041  probable tail length determinator  46.46 
 
 		 704 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  42.81 
 
 		 598 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  42.2 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  45.23 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05040  hypothetical protein  48.02 
 
 		 851 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0709  TP901 family phage tail tape measure protein  40.36 
 
 		 709 aa  369  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  42.74 
 
 		 684 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  42.74 
 
 		 684 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  30.62 
 
 		 656 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  29.71 
 
 		 656 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0910  TP901 family phage tail tape measure protein  29.94 
 
 		 658 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545562  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  29.29 
 
 		 655 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0253  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.41 
 
 		 617 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0574  TP901 family phage tail tape measure protein  34.36 
 
 		 731 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0262287  normal  0.426184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  32.73 
 
 		 1211 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  32.22 
 
 		 1211 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  32.22 
 
 		 1211 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.18 
 
 		 760 aa  135  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1496  hypothetical protein  30.32 
 
 		 234 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  0.205956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.78 
 
 		 733 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  25.4 
 
 		 1216 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  27.27 
 
 		 919 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  23.9 
 
 		 739 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  23.9 
 
 		 739 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  25 
 
 		 680 aa  53.1  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  25.74 
 
 		 920 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.14 
 
 		 981 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  23.78 
 
 		 739 aa  43.5  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>