84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3386 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  100 
 
 		 733 aa  1425    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  40.05 
 
 		 1549 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.45 
 
 		 781 aa  187  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  33.96 
 
 		 2066 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  33.96 
 
 		 2066 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  34.28 
 
 		 1127 aa  177  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  28.26 
 
 		 1216 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  32.7 
 
 		 1183 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  30.05 
 
 		 809 aa  147  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.4 
 
 		 733 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  29.68 
 
 		 971 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  31.12 
 
 		 1183 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  32.46 
 
 		 1183 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  31.43 
 
 		 971 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  29.56 
 
 		 1183 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  29.44 
 
 		 1297 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  29.9 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  31.56 
 
 		 1183 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  28.69 
 
 		 815 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  30.14 
 
 		 1178 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.25 
 
 		 877 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  31.23 
 
 		 1183 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  31.23 
 
 		 1183 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.2 
 
 		 815 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  29.31 
 
 		 813 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.93 
 
 		 1173 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  30.68 
 
 		 969 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  33.23 
 
 		 914 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.55 
 
 		 1478 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  29.6 
 
 		 459 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  25.28 
 
 		 1346 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  24.13 
 
 		 987 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.19 
 
 		 936 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.87 
 
 		 1671 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.87 
 
 		 959 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.87 
 
 		 959 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.06 
 
 		 936 aa  90.9  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  31.03 
 
 		 1211 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  31.03 
 
 		 1211 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  24.87 
 
 		 1283 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  31.82 
 
 		 1211 aa  85.1  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.09 
 
 		 1343 aa  84.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  28.77 
 
 		 1409 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.59 
 
 		 981 aa  80.9  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.1 
 
 		 1371 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  27.33 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.23 
 
 		 719 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  23.83 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  23.56 
 
 		 757 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  23.56 
 
 		 590 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0253  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.69 
 
 		 617 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  32.65 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  25.05 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  25.05 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  23.99 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  42.03 
 
 		 814 aa  59.3  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  27.24 
 
 		 598 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0709  TP901 family phage tail tape measure protein  29.05 
 
 		 709 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  33.68 
 
 		 950 aa  55.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  33.8 
 
 		 959 aa  55.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  26.83 
 
 		 598 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.69 
 
 		 1245 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  24.83 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  23.38 
 
 		 642 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  24.5 
 
 		 641 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  26.87 
 
 		 956 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  21.73 
 
 		 1736 aa  52  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  24.56 
 
 		 605 aa  51.6  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.17 
 
 		 1032 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  24.85 
 
 		 651 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  23.65 
 
 		 1137 aa  47.4  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2149  hypothetical protein  31.34 
 
 		 152 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0644  hypothetical protein  26.95 
 
 		 537 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0395132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  24.14 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  24.07 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0574  TP901 family phage tail tape measure protein  20.4 
 
 		 731 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0262287  normal  0.426184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  23.99 
 
 		 656 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.33 
 
 		 743 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05040  hypothetical protein  26.28 
 
 		 851 aa  45.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  23.5 
 
 		 738 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4272  hypothetical protein  31.55 
 
 		 740 aa  45.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  38.55 
 
 		 1030 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1041  probable tail length determinator  25.69 
 
 		 704 aa  45.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  24.38 
 
 		 997 aa  44.3  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>