51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0750 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  100 
 
 		 950 aa  1848    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  37.67 
 
 		 781 aa  213  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.88 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  31.63 
 
 		 814 aa  201  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  30.68 
 
 		 993 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.47 
 
 		 823 aa  145  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1528  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.6 
 
 		 625 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  30.43 
 
 		 599 aa  132  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  28.42 
 
 		 666 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1557  Phage tail tape measure protein TP901, core region  32.21 
 
 		 722 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.72 
 
 		 817 aa  111  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  25.07 
 
 		 784 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  25.07 
 
 		 784 aa  98.2  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  24.27 
 
 		 784 aa  95.9  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.03 
 
 		 825 aa  95.5  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  25.44 
 
 		 1314 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  24.71 
 
 		 1089 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  22.29 
 
 		 814 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  24.43 
 
 		 916 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  40.2 
 
 		 733 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  22.63 
 
 		 680 aa  70.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  23.3 
 
 		 735 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  25.89 
 
 		 651 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  23.21 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  23.68 
 
 		 641 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  23.89 
 
 		 739 aa  67  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  23.89 
 
 		 739 aa  67  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0743  hypothetical protein  35.57 
 
 		 646 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  22.59 
 
 		 642 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.07 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  23.33 
 
 		 739 aa  60.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.91 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  22.68 
 
 		 902 aa  58.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  33.04 
 
 		 733 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  22.3 
 
 		 956 aa  54.7  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  24.59 
 
 		 1211 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.4 
 
 		 1211 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  25.71 
 
 		 959 aa  53.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  22.22 
 
 		 714 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.4 
 
 		 1211 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08120  putative tail length determinator protein  26.18 
 
 		 745 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000076963  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  25.5 
 
 		 1549 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  20.24 
 
 		 726 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  32.1 
 
 		 1671 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  32.1 
 
 		 959 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  20.89 
 
 		 596 aa  46.2  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  31.25 
 
 		 684 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  31.25 
 
 		 684 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  32.1 
 
 		 959 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  27.78 
 
 		 550 aa  45.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.02 
 
 		 738 aa  44.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>