57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4592 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  88.58 
 
 		 714 aa  1217    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  100 
 
 		 719 aa  1425    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  45.1 
 
 		 651 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  41.18 
 
 		 642 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  41.65 
 
 		 641 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  39.87 
 
 		 642 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  35.24 
 
 		 956 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.22 
 
 		 781 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  31.82 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  27.57 
 
 		 739 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  27.57 
 
 		 739 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  26.62 
 
 		 739 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  30.49 
 
 		 997 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  24.58 
 
 		 738 aa  152  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  30.68 
 
 		 793 aa  138  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  24.19 
 
 		 680 aa  137  8e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  24.9 
 
 		 596 aa  133  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.29 
 
 		 1092 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  24.44 
 
 		 814 aa  75.1  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.16 
 
 		 1095 aa  72.8  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  30.08 
 
 		 925 aa  71.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  23.08 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  25.11 
 
 		 1025 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.33 
 
 		 762 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  26.21 
 
 		 1025 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.37 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  25.77 
 
 		 1025 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.95 
 
 		 950 aa  64.3  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  28.05 
 
 		 935 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.59 
 
 		 733 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  28.09 
 
 		 935 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  25 
 
 		 920 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1148  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.71 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  22.39 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  21.4 
 
 		 721 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  22.94 
 
 		 919 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  27.03 
 
 		 1216 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  24.52 
 
 		 716 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  23.28 
 
 		 784 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  24.06 
 
 		 784 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  23.46 
 
 		 784 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  21.84 
 
 		 759 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.69 
 
 		 743 aa  51.2  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  28.36 
 
 		 887 aa  50.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  21.63 
 
 		 1206 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  21.71 
 
 		 725 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  22.38 
 
 		 781 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  21.79 
 
 		 726 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  22.64 
 
 		 666 aa  47.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0287  hypothetical protein  29.79 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00035869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  21.61 
 
 		 805 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  18.43 
 
 		 811 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  18.43 
 
 		 811 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  24.43 
 
 		 824 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25 
 
 		 817 aa  45.8  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.59 
 
 		 1628 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  20.41 
 
 		 1342 aa  44.3  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>