70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1709 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  100 
 
 		 759 aa  1521    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  24.79 
 
 		 907 aa  209  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  28.61 
 
 		 647 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.96 
 
 		 805 aa  181  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  37.24 
 
 		 841 aa  159  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  29.95 
 
 		 911 aa  157  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  36.4 
 
 		 841 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1269  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1925 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  25.32 
 
 		 818 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3894  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1925 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  25.36 
 
 		 1510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  25.36 
 
 		 1510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  23.7 
 
 		 806 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  26.7 
 
 		 807 aa  118  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  24.74 
 
 		 762 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  27.54 
 
 		 1137 aa  96.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  36.55 
 
 		 1283 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.68 
 
 		 738 aa  93.6  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  24.01 
 
 		 989 aa  93.2  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  24.01 
 
 		 989 aa  93.2  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  23.16 
 
 		 792 aa  91.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  35.17 
 
 		 1346 aa  91.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1206 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  26.15 
 
 		 1347 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  24.76 
 
 		 1347 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  31.9 
 
 		 805 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  25.56 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  29.2 
 
 		 1311 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  29.2 
 
 		 1311 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.49 
 
 		 1297 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1070 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.22 
 
 		 1092 aa  72.4  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  24.58 
 
 		 1077 aa  72  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  30.43 
 
 		 725 aa  72  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  26.36 
 
 		 852 aa  71.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  25.42 
 
 		 1549 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  22.44 
 
 		 737 aa  70.5  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  23.67 
 
 		 1216 aa  69.3  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  27.62 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  27.62 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  27.62 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  26.29 
 
 		 716 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.14 
 
 		 1671 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.14 
 
 		 959 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.14 
 
 		 959 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  24.76 
 
 		 1660 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.15 
 
 		 1095 aa  61.6  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  23.24 
 
 		 1155 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  23.24 
 
 		 1155 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  19.81 
 
 		 975 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  32.06 
 
 		 1178 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  23.65 
 
 		 693 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  21.74 
 
 		 1995 aa  55.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  33.33 
 
 		 959 aa  52.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.21 
 
 		 719 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  26.52 
 
 		 1566 aa  49.3  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  23.68 
 
 		 877 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  23.91 
 
 		 767 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7579  hypothetical protein  25.98 
 
 		 487 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.683042  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  25 
 
 		 874 aa  46.6  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  24.84 
 
 		 1084 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  29.17 
 
 		 2066 aa  46.2  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  19.95 
 
 		 919 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  29.17 
 
 		 2066 aa  46.2  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  34.41 
 
 		 786 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  22.96 
 
 		 824 aa  44.3  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1303  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.75 
 
 		 1156 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1687  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.75 
 
 		 1156 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2263  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.75 
 
 		 1156 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  30.84 
 
 		 1030 aa  43.9  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>