70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3027 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  63.15 
 
 		 550 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  100 
 
 		 935 aa  1870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  64.49 
 
 		 1025 aa  1123    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  99.36 
 
 		 935 aa  1854    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  67.73 
 
 		 1025 aa  802    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  63.8 
 
 		 1025 aa  1100    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  36.05 
 
 		 959 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  31.8 
 
 		 971 aa  355  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  31.68 
 
 		 971 aa  343  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  34.72 
 
 		 739 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  34.41 
 
 		 739 aa  310  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  34.41 
 
 		 739 aa  310  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  29.05 
 
 		 877 aa  300  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  33.63 
 
 		 809 aa  293  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  31.99 
 
 		 815 aa  290  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.97 
 
 		 815 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  29.25 
 
 		 956 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  50.29 
 
 		 813 aa  168  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  27.46 
 
 		 863 aa  161  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  48 
 
 		 361 aa  160  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.74 
 
 		 877 aa  153  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  23 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  41.99 
 
 		 459 aa  142  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  23.99 
 
 		 997 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  25.37 
 
 		 738 aa  135  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.01 
 
 		 1032 aa  127  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  29.26 
 
 		 641 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  28.72 
 
 		 642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  41.28 
 
 		 887 aa  118  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  36.17 
 
 		 919 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  27.72 
 
 		 920 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  28.46 
 
 		 642 aa  115  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  44.6 
 
 		 701 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  28.88 
 
 		 1078 aa  95.5  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.63 
 
 		 781 aa  95.9  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  26.89 
 
 		 651 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.1 
 
 		 762 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  33.52 
 
 		 737 aa  92.8  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  30.86 
 
 		 986 aa  92  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  25.04 
 
 		 714 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.05 
 
 		 719 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.07 
 
 		 823 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  27.22 
 
 		 1216 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  27.65 
 
 		 793 aa  77  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.61 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  30.45 
 
 		 858 aa  67.8  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  23.15 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  32.14 
 
 		 1183 aa  62.4  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  32.14 
 
 		 1183 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  32.14 
 
 		 1183 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  20.24 
 
 		 1030 aa  61.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  31.15 
 
 		 1183 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  31.15 
 
 		 1183 aa  60.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  31.15 
 
 		 1183 aa  58.9  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  26.98 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  33.1 
 
 		 1183 aa  57.8  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  26.98 
 
 		 784 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  26.51 
 
 		 784 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.52 
 
 		 825 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  30.12 
 
 		 824 aa  51.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 		 1170 aa  48.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 		 1142 aa  48.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.05 
 
 		 743 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 		 1170 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.63 
 
 		 1671 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  25.15 
 
 		 1283 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 		 1206 aa  45.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  21.8 
 
 		 1549 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1198 aa  44.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1198 aa  44.3  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>