55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1488 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 781 aa  1550    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  47.17 
 
 		 743 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  37.67 
 
 		 950 aa  213  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  32.18 
 
 		 993 aa  204  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  37.77 
 
 		 814 aa  203  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.51 
 
 		 823 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1557  Phage tail tape measure protein TP901, core region  34.91 
 
 		 722 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  34.39 
 
 		 599 aa  138  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  40.65 
 
 		 858 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1528  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.48 
 
 		 625 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  22.68 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  28.89 
 
 		 814 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  22.84 
 
 		 784 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  22.35 
 
 		 784 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  27.46 
 
 		 916 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  28.19 
 
 		 1089 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  27.59 
 
 		 1314 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  28.65 
 
 		 666 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.82 
 
 		 817 aa  102  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.83 
 
 		 825 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  34.74 
 
 		 902 aa  86.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.56 
 
 		 1032 aa  82.8  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.47 
 
 		 959 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  27.83 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  27.7 
 
 		 1025 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  27.45 
 
 		 1025 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0743  hypothetical protein  31.43 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  27.7 
 
 		 1025 aa  70.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  23.45 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  23.45 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  28.84 
 
 		 935 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  28.84 
 
 		 935 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  22.03 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0746  phage tail tape measure family protein  25.76 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0691  phage tail tape measure family protein  25.76 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  27.56 
 
 		 971 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  27.75 
 
 		 971 aa  61.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  19.01 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  26.74 
 
 		 737 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  46.43 
 
 		 957 aa  54.7  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  21.47 
 
 		 738 aa  54.3  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  58.54 
 
 		 174 aa  54.3  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  22.76 
 
 		 919 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  58.33 
 
 		 974 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  30.51 
 
 		 651 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  23 
 
 		 920 aa  51.6  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  32.91 
 
 		 1078 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.1 
 
 		 719 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  27.45 
 
 		 1030 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  27.27 
 
 		 641 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  27.27 
 
 		 642 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  29.74 
 
 		 877 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  24.03 
 
 		 956 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  26.57 
 
 		 642 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  52.78 
 
 		 472 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>