93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01340 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  100 
 
 		 956 aa  1872    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  55.52 
 
 		 642 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  55.24 
 
 		 641 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  54.83 
 
 		 642 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  44.73 
 
 		 651 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.5 
 
 		 719 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  32.37 
 
 		 714 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  41.23 
 
 		 781 aa  217  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  27.53 
 
 		 997 aa  215  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  27.53 
 
 		 935 aa  214  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  27.52 
 
 		 935 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  35.73 
 
 		 793 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  26.81 
 
 		 680 aa  186  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  34.39 
 
 		 919 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  27.38 
 
 		 1025 aa  172  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  27.26 
 
 		 809 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  27.26 
 
 		 1025 aa  163  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  34.38 
 
 		 920 aa  160  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  24.1 
 
 		 1216 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  26.8 
 
 		 815 aa  154  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.54 
 
 		 815 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  25.9 
 
 		 863 aa  150  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  28.52 
 
 		 1025 aa  146  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  29.51 
 
 		 738 aa  141  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  27.93 
 
 		 739 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  27.93 
 
 		 739 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  27.66 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  32.99 
 
 		 986 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.92 
 
 		 877 aa  124  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.6 
 
 		 823 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  34.48 
 
 		 887 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.24 
 
 		 1032 aa  108  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.41 
 
 		 959 aa  106  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  37.02 
 
 		 1078 aa  100  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  34.68 
 
 		 813 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  22.4 
 
 		 877 aa  99  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  34.9 
 
 		 971 aa  96.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  26.3 
 
 		 550 aa  97.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.81 
 
 		 1092 aa  96.3  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.28 
 
 		 762 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  34.23 
 
 		 971 aa  94.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  24.21 
 
 		 877 aa  81.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  31.79 
 
 		 361 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1148  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.52 
 
 		 826 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  27.51 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  26.24 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  24.41 
 
 		 1155 aa  68.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  24.41 
 
 		 1155 aa  68.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.31 
 
 		 1628 aa  66.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.02 
 
 		 1095 aa  65.1  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  21.09 
 
 		 814 aa  62.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  33.76 
 
 		 1183 aa  63.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  23.59 
 
 		 781 aa  62  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  25.04 
 
 		 945 aa  61.6  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  25.04 
 
 		 945 aa  61.6  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  26.79 
 
 		 784 aa  61.6  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  33.12 
 
 		 1183 aa  61.6  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27.68 
 
 		 784 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  26.91 
 
 		 784 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  29.38 
 
 		 993 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  32.48 
 
 		 1183 aa  60.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.85 
 
 		 950 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.18 
 
 		 733 aa  59.7  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  33.12 
 
 		 1183 aa  59.3  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  31.85 
 
 		 1183 aa  58.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  22.3 
 
 		 1137 aa  58.2  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  31.13 
 
 		 1297 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  30.57 
 
 		 1183 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  42.47 
 
 		 1136 aa  56.2  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  42.47 
 
 		 1136 aa  56.2  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  37.68 
 
 		 871 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.06 
 
 		 1671 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  19.03 
 
 		 760 aa  55.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.06 
 
 		 959 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.06 
 
 		 959 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.58 
 
 		 1342 aa  53.9  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.02 
 
 		 743 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  36.23 
 
 		 786 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  32.11 
 
 		 759 aa  52.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  28.16 
 
 		 806 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  38.57 
 
 		 1084 aa  52  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1089 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  37.68 
 
 		 852 aa  48.9  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.71 
 
 		 817 aa  48.5  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  19.24 
 
 		 907 aa  47.8  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  38.89 
 
 		 818 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  26.63 
 
 		 684 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  26.63 
 
 		 684 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  22.96 
 
 		 989 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  22.96 
 
 		 989 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  22.49 
 
 		 824 aa  47.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  24.8 
 
 		 1183 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  22.11 
 
 		 762 aa  45.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>