47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2256 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  100 
 
 		 642 aa  1284    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  97.65 
 
 		 641 aa  1211    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  94.39 
 
 		 642 aa  1182    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  41.19 
 
 		 651 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  55.46 
 
 		 956 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  41.39 
 
 		 719 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  40.69 
 
 		 714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  42.9 
 
 		 781 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  35.25 
 
 		 997 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  33.08 
 
 		 793 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  26.79 
 
 		 680 aa  160  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  33.89 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  24.5 
 
 		 739 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  24.5 
 
 		 739 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  25.09 
 
 		 739 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  29.47 
 
 		 1025 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  29.47 
 
 		 1025 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  29.21 
 
 		 1025 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  26.83 
 
 		 550 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.44 
 
 		 762 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  28.21 
 
 		 935 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  27.89 
 
 		 935 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.03 
 
 		 1095 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.49 
 
 		 1628 aa  84.3  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.38 
 
 		 1092 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1148  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.16 
 
 		 826 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  24.03 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.97 
 
 		 950 aa  68.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  23.93 
 
 		 784 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.57 
 
 		 784 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  23.57 
 
 		 784 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.12 
 
 		 823 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.35 
 
 		 733 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  20.57 
 
 		 1342 aa  50.4  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  21.62 
 
 		 814 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.64 
 
 		 825 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  24.57 
 
 		 656 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  27.27 
 
 		 781 aa  47.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  23.66 
 
 		 656 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.68 
 
 		 815 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  25.68 
 
 		 815 aa  45.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  23.65 
 
 		 655 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  23.37 
 
 		 1127 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  19.14 
 
 		 590 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  23.29 
 
 		 916 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  20.92 
 
 		 919 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.24 
 
 		 817 aa  44.3  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>