25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2178 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 1342 aa  2637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  47.88 
 
 		 1628 aa  352  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.96 
 
 		 1092 aa  317  9e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  40.25 
 
 		 1095 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  26.49 
 
 		 680 aa  111  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3243  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.14 
 
 		 1419 aa  97.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.948991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3592  TP901 family phage tail tape measure protein  28.93 
 
 		 1426 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0797  TP901 family phage tail tape measure protein  28.93 
 
 		 1426 aa  96.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.274443 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  27.47 
 
 		 738 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  25.99 
 
 		 793 aa  75.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  24.05 
 
 		 739 aa  68.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  24.05 
 
 		 739 aa  68.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.22 
 
 		 762 aa  67  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  23.16 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.06 
 
 		 781 aa  59.7  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  22.52 
 
 		 651 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  23.87 
 
 		 956 aa  55.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  25.68 
 
 		 997 aa  52.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  24.03 
 
 		 642 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  22.25 
 
 		 642 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  22.62 
 
 		 641 aa  49.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  21.72 
 
 		 1549 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1304 aa  46.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0628318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  24.59 
 
 		 914 aa  46.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  35.29 
 
 		 620 aa  45.8  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>