42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0522 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 1628 aa  3222    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  47.88 
 
 		 1342 aa  322  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.64 
 
 		 1092 aa  251  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  36.07 
 
 		 1095 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  26.37 
 
 		 680 aa  120  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  25.39 
 
 		 738 aa  102  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3592  TP901 family phage tail tape measure protein  29.52 
 
 		 1426 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0797  TP901 family phage tail tape measure protein  29.52 
 
 		 1426 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.274443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3243  Phage tail tape measure protein TP901, core region  29.51 
 
 		 1419 aa  97.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.948991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  25.87 
 
 		 642 aa  96.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  25.62 
 
 		 641 aa  89.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  25.12 
 
 		 642 aa  88.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  24.55 
 
 		 651 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  26.1 
 
 		 793 aa  79.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  24.83 
 
 		 739 aa  70.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  24.83 
 
 		 739 aa  70.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  24.3 
 
 		 956 aa  67.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  50 
 
 		 915 aa  63.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  50 
 
 		 669 aa  61.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.96 
 
 		 1343 aa  61.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  23.5 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.02 
 
 		 762 aa  60.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  43.94 
 
 		 908 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  42.25 
 
 		 1190 aa  58.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  58.33 
 
 		 193 aa  57.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  44.93 
 
 		 1096 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1353 aa  55.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  41.27 
 
 		 1263 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  45.78 
 
 		 921 aa  53.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 		 1160 aa  53.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 		 701 aa  53.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  41.27 
 
 		 1248 aa  52.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  41.27 
 
 		 1203 aa  52.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  37.14 
 
 		 1120 aa  50.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  42.03 
 
 		 139 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  42.65 
 
 		 968 aa  48.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.82 
 
 		 781 aa  48.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  68.97 
 
 		 1268 aa  47.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  45.61 
 
 		 191 aa  47.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  51.28 
 
 		 991 aa  46.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 1285 aa  45.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  24.52 
 
 		 997 aa  45.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>