44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1449 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1120 aa  2237    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  23.44 
 
 		 2066 aa  84  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  23.44 
 
 		 2066 aa  84  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  24.6 
 
 		 1347 aa  81.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  24.38 
 
 		 1347 aa  81.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2263  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.28 
 
 		 1156 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1687  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.28 
 
 		 1156 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1303  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.28 
 
 		 1156 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  61.4 
 
 		 1096 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  24.39 
 
 		 1127 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  50.75 
 
 		 915 aa  68.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.42 
 
 		 981 aa  65.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  56.9 
 
 		 1190 aa  66.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  49.28 
 
 		 1263 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  46.38 
 
 		 1353 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  56.14 
 
 		 1203 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  56.14 
 
 		 1248 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  55.17 
 
 		 1160 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  25.21 
 
 		 921 aa  62  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  53.45 
 
 		 921 aa  61.6  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  32.59 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  21.82 
 
 		 1216 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  49.12 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  51.79 
 
 		 701 aa  60.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  50 
 
 		 914 aa  58.9  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.59 
 
 		 1173 aa  58.2  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.58 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  22.97 
 
 		 1549 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  50.82 
 
 		 1285 aa  54.7  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1192 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  43.33 
 
 		 139 aa  52  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  50.88 
 
 		 968 aa  51.6  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  22.07 
 
 		 1178 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.14 
 
 		 1628 aa  50.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  21.51 
 
 		 969 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  18.22 
 
 		 1297 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  19.69 
 
 		 1084 aa  48.5  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  21.6 
 
 		 1409 aa  48.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.78 
 
 		 738 aa  47.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  45.28 
 
 		 1268 aa  48.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1164 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  24.76 
 
 		 767 aa  46.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  47.22 
 
 		 1023 aa  45.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.57 
 
 		 1343 aa  45.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>