38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1587 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 1285 aa  2499    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  49.46 
 
 		 1164 aa  788    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  34.14 
 
 		 1160 aa  361  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  34.39 
 
 		 1190 aa  326  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1192 aa  291  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1203 aa  240  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1248 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1096 aa  165  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  28.27 
 
 		 1115 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  56.57 
 
 		 914 aa  112  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  37.31 
 
 		 921 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1127 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1268 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1263 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1353 aa  103  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  40.34 
 
 		 701 aa  90.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  67.74 
 
 		 968 aa  90.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  37.72 
 
 		 1122 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1032 aa  74.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  34.25 
 
 		 781 aa  74.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1032 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  50.77 
 
 		 915 aa  70.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  51.56 
 
 		 669 aa  66.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  53.97 
 
 		 139 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  36.8 
 
 		 794 aa  62  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  33.55 
 
 		 908 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  36.51 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  50.82 
 
 		 1120 aa  55.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6515  hypothetical protein  46.27 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  39.71 
 
 		 853 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  26.81 
 
 		 957 aa  50.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  38.89 
 
 		 1167 aa  50.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  39.71 
 
 		 853 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  38.24 
 
 		 857 aa  48.5  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  38.24 
 
 		 853 aa  48.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  30.3 
 
 		 735 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  30.3 
 
 		 735 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.19 
 
 		 1628 aa  46.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>