67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4067 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  42.6 
 
 		 1160 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  58.15 
 
 		 1190 aa  1112    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  100 
 
 		 1263 aa  2514    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  71.33 
 
 		 1353 aa  1499    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  58.33 
 
 		 1192 aa  1051    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  48.76 
 
 		 1248 aa  861    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  46.84 
 
 		 1203 aa  818    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1096 aa  307  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1164 aa  227  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  32.94 
 
 		 1115 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1127 aa  161  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  38.93 
 
 		 1032 aa  152  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1032 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1268 aa  125  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 1285 aa  105  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  33.76 
 
 		 783 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  30.6 
 
 		 457 aa  100  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  39.29 
 
 		 237 aa  98.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  41.51 
 
 		 669 aa  97.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  39.13 
 
 		 255 aa  95.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  30.88 
 
 		 914 aa  94  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  26.73 
 
 		 1122 aa  92.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  36.67 
 
 		 671 aa  92  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  33.03 
 
 		 871 aa  89.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  59.38 
 
 		 915 aa  88.6  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  44.76 
 
 		 139 aa  85.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  33.77 
 
 		 921 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  56.16 
 
 		 794 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  30.39 
 
 		 908 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  34.24 
 
 		 870 aa  71.6  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  34.62 
 
 		 881 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  37.21 
 
 		 968 aa  70.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  26.01 
 
 		 1063 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  25.39 
 
 		 1167 aa  69.7  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  42.57 
 
 		 859 aa  68.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  42.57 
 
 		 859 aa  68.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  42.57 
 
 		 881 aa  68.6  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  42.57 
 
 		 881 aa  68.6  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  33.6 
 
 		 857 aa  67.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  33.97 
 
 		 881 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  24.56 
 
 		 970 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  41.26 
 
 		 853 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  41.26 
 
 		 853 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  60 
 
 		 853 aa  66.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  49.28 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  40.91 
 
 		 701 aa  64.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  36 
 
 		 849 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  29.21 
 
 		 1906 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  30 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  27.43 
 
 		 1364 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  38.64 
 
 		 1628 aa  55.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  53.85 
 
 		 647 aa  55.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  25.83 
 
 		 957 aa  55.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1724 aa  54.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  26.56 
 
 		 1835 aa  54.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1724 aa  54.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  25 
 
 		 1021 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  25 
 
 		 1555 aa  53.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  23.94 
 
 		 1031 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  23.86 
 
 		 1028 aa  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  29.09 
 
 		 781 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  23.94 
 
 		 1031 aa  48.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  36.26 
 
 		 1343 aa  47.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  23.06 
 
 		 1161 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  22.99 
 
 		 1028 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  22.99 
 
 		 1028 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  27.49 
 
 		 372 aa  44.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>