26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1993 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  357  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  49.21 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  35.26 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0537  hypothetical protein  35.33 
 
 		 792 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.216857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  38.12 
 
 		 957 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  28.37 
 
 		 715 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  65.85 
 
 		 858 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  60 
 
 		 991 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  39.77 
 
 		 735 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  33.53 
 
 		 674 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1604  hypothetical protein  38.04 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  45.57 
 
 		 341 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  34.02 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  39.07 
 
 		 422 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  68.75 
 
 		 974 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  47.92 
 
 		 1628 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3433  hypothetical protein  37.97 
 
 		 613 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.709149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  33.51 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  36.71 
 
 		 743 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3907  hypothetical protein  59.46 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.110092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  40.21 
 
 		 913 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  46 
 
 		 902 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  64.52 
 
 		 472 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  40.32 
 
 		 781 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  28.76 
 
 		 1063 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  58.06 
 
 		 775 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>