26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7316 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  100 
 
 		 674 aa  1331    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  37.94 
 
 		 341 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  36.36 
 
 		 422 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  30.57 
 
 		 735 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1032 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  40.19 
 
 		 1032 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  28.04 
 
 		 732 aa  74.7  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  33.64 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  33.18 
 
 		 181 aa  70.5  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  25.08 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  34.25 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  36.18 
 
 		 192 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  29.59 
 
 		 222 aa  52.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  31.77 
 
 		 188 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  32.12 
 
 		 196 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  30.15 
 
 		 197 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  24.76 
 
 		 222 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  32.11 
 
 		 190 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  38.37 
 
 		 193 aa  47.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  29.56 
 
 		 195 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  29.1 
 
 		 194 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  26.79 
 
 		 216 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  28.18 
 
 		 991 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  26.79 
 
 		 206 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  46.77 
 
 		 191 aa  45.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  26.85 
 
 		 223 aa  44.3  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>