48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1642 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  100 
 
 
222 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  60.55 
 
 
222 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  61.65 
 
 
223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  59.42 
 
 
206 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  57.01 
 
 
216 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  56.54 
 
 
217 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  56.94 
 
 
219 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  41.9 
 
 
205 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  43.75 
 
 
196 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  45.09 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  43.93 
 
 
190 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  44.63 
 
 
199 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  41.24 
 
 
197 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  54.55 
 
 
192 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  40.78 
 
 
195 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  40.31 
 
 
194 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1418  gene transfer agent (GTA) orfg11  42.61 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303639  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  43.93 
 
 
189 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  43.93 
 
 
181 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1422  gene transfer agent (GTA) orfg11  39.78 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0992875  normal  0.120159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1696  gene transfer agent (GTA) orfg11  40.33 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1422  gene transfer agent (GTA) like protein  38.97 
 
 
194 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  50 
 
 
1063 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  39.47 
 
 
1075 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  45.24 
 
 
1031 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  45.24 
 
 
1031 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  36.75 
 
 
1080 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  36.75 
 
 
1080 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  36.75 
 
 
1080 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  36.75 
 
 
1080 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  39.53 
 
 
1028 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  39.53 
 
 
1028 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  39.53 
 
 
1028 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  50.7 
 
 
1021 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  44.79 
 
 
1161 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  46.07 
 
 
1104 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  26.54 
 
 
911 aa  61.6  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  61.22 
 
 
938 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  41.49 
 
 
612 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  41.49 
 
 
611 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  52.83 
 
 
1095 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  42.39 
 
 
1251 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  24.76 
 
 
674 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  40.79 
 
 
1609 aa  45.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  26.43 
 
 
1206 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  31.52 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.7 
 
 
805 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  29.38 
 
 
760 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>