48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4292 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  100 
 
 		 1032 aa  2028    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  95.06 
 
 		 1032 aa  1795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  36.35 
 
 		 1096 aa  423  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  53.52 
 
 		 457 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1203 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1353 aa  300  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  30.3 
 
 		 1190 aa  299  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  30.44 
 
 		 1248 aa  280  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1263 aa  273  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1192 aa  240  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  30.56 
 
 		 1115 aa  157  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1164 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  31.69 
 
 		 1160 aa  137  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1127 aa  125  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1268 aa  105  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  42.94 
 
 		 794 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 1285 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  42.59 
 
 		 783 aa  87  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  32.95 
 
 		 871 aa  87  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  40.19 
 
 		 674 aa  85.1  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  44.35 
 
 		 915 aa  83.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  44.16 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  33.22 
 
 		 701 aa  81.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  36.64 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  97.37 
 
 		 735 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  30.66 
 
 		 669 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  39.81 
 
 		 255 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  41.44 
 
 		 921 aa  69.7  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  31.52 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  55.93 
 
 		 139 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  56 
 
 		 647 aa  65.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  82.86 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  31.47 
 
 		 908 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  29.46 
 
 		 1122 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  35.79 
 
 		 718 aa  54.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  33.96 
 
 		 274 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  22.8 
 
 		 1167 aa  53.5  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  28 
 
 		 671 aa  51.6  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  27.02 
 
 		 1835 aa  49.7  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  20.44 
 
 		 913 aa  48.5  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  37.04 
 
 		 192 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  39.74 
 
 		 1120 aa  47.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  30.94 
 
 		 735 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  29.51 
 
 		 1906 aa  47  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  30.94 
 
 		 735 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  31.77 
 
 		 205 aa  45.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  29.33 
 
 		 968 aa  45.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  26.32 
 
 		 957 aa  44.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>