17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3128 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  48.33 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  32.52 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  46.25 
 
 		 1628 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  33.75 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  37 
 
 		 735 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  33.74 
 
 		 674 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  44.3 
 
 		 957 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  48.44 
 
 		 858 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  47.27 
 
 		 472 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  60 
 
 		 991 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  56.1 
 
 		 974 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  38.18 
 
 		 422 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  25.82 
 
 		 715 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1604  hypothetical protein  63.64 
 
 		 134 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  50 
 
 		 781 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0537  hypothetical protein  31.19 
 
 		 792 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.216857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>