15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1312 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  927    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  46.84 
 
 		 957 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  38.54 
 
 		 974 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  69.23 
 
 		 858 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1604  hypothetical protein  55.36 
 
 		 134 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  31.07 
 
 		 726 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  32.35 
 
 		 174 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  35.59 
 
 		 902 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  54.05 
 
 		 781 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3494  hypothetical protein  60 
 
 		 852 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0571399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  48.98 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  36.11 
 
 		 828 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  40.51 
 
 		 341 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  50 
 
 		 991 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  27.88 
 
 		 674 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>