27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0929 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  334  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  32.52 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  29.19 
 
 		 957 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  50 
 
 		 902 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  56.25 
 
 		 781 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  42.11 
 
 		 974 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  39.2 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  36.63 
 
 		 668 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  37.62 
 
 		 671 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  32.35 
 
 		 472 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  31.61 
 
 		 341 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  63.16 
 
 		 858 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  40 
 
 		 913 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  37.63 
 
 		 419 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  31.95 
 
 		 422 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  53.33 
 
 		 991 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1604  hypothetical protein  63.64 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  34.51 
 
 		 674 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3907  hypothetical protein  31.93 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.110092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  27.27 
 
 		 715 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  38.2 
 
 		 735 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3494  hypothetical protein  37.14 
 
 		 852 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0571399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  64.52 
 
 		 1628 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  31.31 
 
 		 914 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  55.56 
 
 		 743 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  29.13 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  36.26 
 
 		 726 aa  40.8  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>