19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3387 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  100 
 
 
715 aa  1442    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  34.35 
 
 
671 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  29.29 
 
 
756 aa  102  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0537  hypothetical protein  23.58 
 
 
792 aa  87  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.216857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  30.8 
 
 
828 aa  80.5  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  27.87 
 
 
540 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  33.33 
 
 
762 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1643  hypothetical protein  30.9 
 
 
824 aa  75.1  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304557  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  25.86 
 
 
600 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  29.29 
 
 
824 aa  54.7  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  29.41 
 
 
691 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  28.88 
 
 
851 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  41.67 
 
 
191 aa  48.5  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  25.58 
 
 
814 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  22.15 
 
 
1521 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  27.81 
 
 
701 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  19.33 
 
 
853 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  23.3 
 
 
925 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3433  hypothetical protein  44.83 
 
 
613 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.709149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>