17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3161 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  100 
 
 
828 aa  1647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  27.68 
 
 
671 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  30.8 
 
 
715 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  29.07 
 
 
762 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  23.37 
 
 
851 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  27.92 
 
 
756 aa  56.6  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  27.16 
 
 
913 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  25.67 
 
 
540 aa  54.7  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  29.59 
 
 
794 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  24.84 
 
 
629 aa  51.2  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  24.84 
 
 
629 aa  51.2  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  30.41 
 
 
781 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  24.44 
 
 
629 aa  49.3  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1643  hypothetical protein  31.01 
 
 
824 aa  48.5  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304557  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  30.3 
 
 
674 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  26.07 
 
 
600 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  28.41 
 
 
824 aa  44.3  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>