55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1281 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  100 
 
 		 824 aa  1632    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  31.47 
 
 		 925 aa  164  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  26.22 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  41.9 
 
 		 756 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2014  hypothetical protein  28.54 
 
 		 510 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  23.66 
 
 		 762 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  27.85 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  39.64 
 
 		 887 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  28.51 
 
 		 671 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  22.73 
 
 		 739 aa  71.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  22.73 
 
 		 739 aa  71.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  27.82 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.55 
 
 		 817 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  22.77 
 
 		 629 aa  70.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  22.77 
 
 		 629 aa  70.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  27.44 
 
 		 784 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27.84 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  27.81 
 
 		 596 aa  67.4  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  29.29 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  24.76 
 
 		 907 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  47.37 
 
 		 877 aa  63.9  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  26.92 
 
 		 574 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.25 
 
 		 959 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  45.31 
 
 		 666 aa  61.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  34.29 
 
 		 919 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  22.41 
 
 		 629 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  25.42 
 
 		 550 aa  57.4  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  35.67 
 
 		 993 aa  57  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.1 
 
 		 823 aa  55.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  32.65 
 
 		 920 aa  54.3  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  24.55 
 
 		 717 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  32.84 
 
 		 775 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  26.23 
 
 		 811 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  23.02 
 
 		 600 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.97 
 
 		 1032 aa  52  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  32.35 
 
 		 877 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  21.66 
 
 		 680 aa  49.7  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  28.41 
 
 		 828 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  20.85 
 
 		 805 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  25.14 
 
 		 1216 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1236  hypothetical protein  22.42 
 
 		 523 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  25.43 
 
 		 781 aa  48.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  31.48 
 
 		 1078 aa  47.8  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  31.82 
 
 		 701 aa  47.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.43 
 
 		 719 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  22.59 
 
 		 814 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.47 
 
 		 825 aa  45.8  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  23.31 
 
 		 647 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  24.68 
 
 		 794 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  27.22 
 
 		 590 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  22.53 
 
 		 956 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  23.21 
 
 		 866 aa  45.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  21.61 
 
 		 1137 aa  45.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  26.67 
 
 		 935 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.12 
 
 		 733 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>