37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0859 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 701 aa  1413    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  33.58 
 
 		 550 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  38.52 
 
 		 877 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  45.19 
 
 		 1025 aa  106  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  31.05 
 
 		 1025 aa  104  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  44.53 
 
 		 1025 aa  103  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  26.91 
 
 		 1216 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  28.76 
 
 		 809 aa  96.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  26.91 
 
 		 971 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  44.35 
 
 		 935 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  43.55 
 
 		 935 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  44.17 
 
 		 971 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.09 
 
 		 959 aa  89  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.89 
 
 		 815 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  30.51 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.34 
 
 		 877 aa  83.2  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  27.21 
 
 		 815 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  27.35 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  26.77 
 
 		 361 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  41.58 
 
 		 1032 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  32.65 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  25.74 
 
 		 920 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  24.47 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  25 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.75 
 
 		 817 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  28.24 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  28.24 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  24.26 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  25 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  23.74 
 
 		 2066 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  23.74 
 
 		 2066 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  24.48 
 
 		 784 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  29.03 
 
 		 596 aa  54.3  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  23.79 
 
 		 887 aa  51.2  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3667  hypothetical protein  28.7 
 
 		 191 aa  50.8  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  30.21 
 
 		 824 aa  48.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  27.03 
 
 		 1549 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>