More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1091 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 
2066 aa  4190    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 
2066 aa  4190    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  38.04 
 
 
1127 aa  237  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  31.26 
 
 
1549 aa  235  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  38.4 
 
 
1297 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  29.32 
 
 
1178 aa  213  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  33.96 
 
 
733 aa  179  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  27.45 
 
 
1510 aa  169  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  27.45 
 
 
1510 aa  169  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.45 
 
 
1173 aa  167  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  32.3 
 
 
1216 aa  163  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.11 
 
 
877 aa  158  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  23.43 
 
 
971 aa  152  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  28.85 
 
 
975 aa  145  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  26.15 
 
 
1183 aa  144  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  23.1 
 
 
1346 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  26.15 
 
 
1183 aa  142  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  30.58 
 
 
1183 aa  142  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  25.38 
 
 
1183 aa  142  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  30.58 
 
 
1183 aa  141  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  30.58 
 
 
1183 aa  141  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  23.69 
 
 
1183 aa  139  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  29.92 
 
 
914 aa  137  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  23.2 
 
 
971 aa  134  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.75 
 
 
1343 aa  129  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.78 
 
 
815 aa  121  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.69 
 
 
1478 aa  121  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.22 
 
 
981 aa  120  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  37.2 
 
 
1216 aa  120  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  24.87 
 
 
815 aa  120  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  29.5 
 
 
969 aa  119  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  30.92 
 
 
759 aa  117  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.18 
 
 
1671 aa  115  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  24.93 
 
 
987 aa  113  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.94 
 
 
959 aa  112  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.94 
 
 
959 aa  112  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.72 
 
 
1371 aa  109  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  31.21 
 
 
809 aa  109  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  31.7 
 
 
1409 aa  106  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  21.64 
 
 
1283 aa  102  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2263  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.27 
 
 
1156 aa  94.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1687  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.27 
 
 
1156 aa  94.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.65 
 
 
936 aa  94.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1303  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.27 
 
 
1156 aa  94.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0260  peptidoglycan hydrolase  39.26 
 
 
316 aa  94  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0267  peptidoglycan hydrolase  39.26 
 
 
316 aa  94  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578781  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  31.33 
 
 
813 aa  94  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  28.63 
 
 
757 aa  93.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  36.31 
 
 
1736 aa  92  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  43.59 
 
 
192 aa  90.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  43.59 
 
 
192 aa  90.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  23.44 
 
 
1120 aa  85.1  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.05 
 
 
805 aa  84.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  22.84 
 
 
907 aa  82.4  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  38.81 
 
 
824 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.06 
 
 
1092 aa  81.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  35.04 
 
 
751 aa  79.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1640  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.16 
 
 
2757 aa  77.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.22 
 
 
936 aa  78.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  45.36 
 
 
266 aa  78.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  35.11 
 
 
743 aa  77.4  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  37.61 
 
 
582 aa  76.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  46.07 
 
 
273 aa  76.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.96 
 
 
590 aa  76.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  44.94 
 
 
244 aa  76.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  31.71 
 
 
1276 aa  75.9  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  35.96 
 
 
430 aa  75.5  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  41.18 
 
 
458 aa  75.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  38.6 
 
 
305 aa  74.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  40.38 
 
 
268 aa  74.7  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  36.5 
 
 
311 aa  73.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.57 
 
 
305 aa  73.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  40 
 
 
353 aa  73.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  24.12 
 
 
1566 aa  73.2  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  35.04 
 
 
198 aa  72.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.5 
 
 
376 aa  72  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  33.93 
 
 
443 aa  72  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  23.71 
 
 
921 aa  72  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  39.09 
 
 
429 aa  72.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  34.31 
 
 
198 aa  71.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  38.3 
 
 
404 aa  70.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  36.36 
 
 
433 aa  70.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  37.6 
 
 
288 aa  71.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  40.19 
 
 
204 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  33.33 
 
 
482 aa  71.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  34.96 
 
 
498 aa  70.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  37.61 
 
 
204 aa  70.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  35.66 
 
 
308 aa  70.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  35.34 
 
 
387 aa  70.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  38.18 
 
 
438 aa  70.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  33.33 
 
 
727 aa  70.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  31.58 
 
 
487 aa  70.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  33.33 
 
 
727 aa  70.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  39.6 
 
 
402 aa  70.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2149  hypothetical protein  44.29 
 
 
152 aa  69.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  35.97 
 
 
346 aa  69.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  39.36 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  36.36 
 
 
223 aa  70.1  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  38.32 
 
 
418 aa  70.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  43.96 
 
 
204 aa  69.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>