99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1375 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  100 
 
 
877 aa  1742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  39.36 
 
 
1216 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  33.06 
 
 
971 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  33.1 
 
 
971 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  29.06 
 
 
815 aa  243  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.04 
 
 
815 aa  241  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  28.96 
 
 
809 aa  238  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  28.47 
 
 
813 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  27.42 
 
 
919 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  27.5 
 
 
863 aa  213  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  37.75 
 
 
887 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  35.25 
 
 
920 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  28.39 
 
 
1549 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  25.4 
 
 
877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  27.12 
 
 
2066 aa  164  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  27.12 
 
 
2066 aa  164  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  31.38 
 
 
784 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  31.38 
 
 
784 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  30.59 
 
 
784 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  26.23 
 
 
1183 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  26.71 
 
 
1183 aa  154  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  25.93 
 
 
1183 aa  154  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  27.03 
 
 
1183 aa  154  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  26.07 
 
 
1183 aa  154  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  26.03 
 
 
1183 aa  152  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  26.49 
 
 
1178 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  29.31 
 
 
1127 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  26.29 
 
 
1183 aa  146  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.39 
 
 
959 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  25.67 
 
 
956 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  35.37 
 
 
817 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.29 
 
 
733 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  34.5 
 
 
975 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  26.53 
 
 
550 aa  128  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  34.05 
 
 
986 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  30.79 
 
 
459 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  29.23 
 
 
361 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  25.44 
 
 
1078 aa  118  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  26.8 
 
 
1297 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.25 
 
 
825 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  23.96 
 
 
739 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  25.56 
 
 
935 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  23.57 
 
 
739 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  23.57 
 
 
739 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.04 
 
 
981 aa  94.7  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  25.08 
 
 
759 aa  94.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  27.22 
 
 
1671 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.02 
 
 
1173 aa  93.2  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  25.84 
 
 
1283 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.94 
 
 
1478 aa  89.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  21.42 
 
 
814 aa  89.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.75 
 
 
959 aa  89.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.75 
 
 
959 aa  89.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  25.12 
 
 
1346 aa  87.4  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  24.23 
 
 
987 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  30.1 
 
 
969 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.17 
 
 
1032 aa  85.5  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  29.38 
 
 
757 aa  83.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  27.4 
 
 
914 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  24.11 
 
 
1030 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  25.34 
 
 
701 aa  82  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  28.98 
 
 
935 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  23.67 
 
 
680 aa  79  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  23.55 
 
 
945 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  23.55 
 
 
945 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  26.4 
 
 
1025 aa  74.7  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  20.94 
 
 
760 aa  72.8  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.63 
 
 
1371 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  30.98 
 
 
993 aa  72.4  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  23 
 
 
1025 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  48 
 
 
775 aa  68.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  24.92 
 
 
1025 aa  66.6  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.48 
 
 
1343 aa  65.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  47.37 
 
 
824 aa  63.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  46.88 
 
 
540 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  22.12 
 
 
596 aa  62  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.11 
 
 
719 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  24.23 
 
 
1409 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  30.47 
 
 
921 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  21.33 
 
 
997 aa  55.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  23.08 
 
 
1736 aa  54.7  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  23.86 
 
 
714 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.83 
 
 
1245 aa  53.5  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  24.85 
 
 
582 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.58 
 
 
936 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  26.9 
 
 
1137 aa  51.2  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  40.85 
 
 
1089 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  31.33 
 
 
925 aa  49.7  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  30.82 
 
 
590 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.29 
 
 
936 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3667  hypothetical protein  40.85 
 
 
191 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  21.07 
 
 
642 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0574  TP901 family phage tail tape measure protein  20.99 
 
 
731 aa  47.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0262287  normal  0.426184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  35.21 
 
 
1084 aa  47  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  28.21 
 
 
647 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2014  hypothetical protein  35.14 
 
 
510 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  20.92 
 
 
1211 aa  44.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  36.17 
 
 
877 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  21.87 
 
 
907 aa  44.3  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>