79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0181 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  42.87 
 
 		 887 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  100 
 
 		 919 aa  1840    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  92.11 
 
 		 920 aa  1682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  50.8 
 
 		 986 aa  894    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  43.71 
 
 		 1078 aa  243  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  33.06 
 
 		 956 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  34.69 
 
 		 877 aa  164  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  39.66 
 
 		 863 aa  138  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  35.42 
 
 		 1216 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.38 
 
 		 1032 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1491  hypothetical protein  25.42 
 
 		 768 aa  104  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  37.91 
 
 		 971 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  37.91 
 
 		 971 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6588  hypothetical protein  26.22 
 
 		 668 aa  101  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.03 
 
 		 959 aa  101  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  29.24 
 
 		 1025 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  36.59 
 
 		 809 aa  98.2  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  29.7 
 
 		 1025 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  29.58 
 
 		 935 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  29.58 
 
 		 935 aa  95.1  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  38.61 
 
 		 813 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2478  hypothetical protein  24.82 
 
 		 642 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.69 
 
 		 823 aa  91.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.3 
 
 		 815 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  43.3 
 
 		 815 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  25.83 
 
 		 877 aa  84.7  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  34.45 
 
 		 784 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  34.45 
 
 		 784 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  43.88 
 
 		 459 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  32.54 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1088 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  28.38 
 
 		 1025 aa  80.5  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  30.9 
 
 		 361 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  32.24 
 
 		 945 aa  79.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  32.24 
 
 		 945 aa  79.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  24.19 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  27.31 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  27.31 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.08 
 
 		 817 aa  72.4  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  19.21 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  29.17 
 
 		 737 aa  69.3  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  27.65 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2296  hypothetical protein  23.24 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.23 
 
 		 825 aa  63.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  26.07 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  34.29 
 
 		 824 aa  60.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  30.77 
 
 		 993 aa  60.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  37.27 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  40 
 
 		 1137 aa  57.4  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  34.82 
 
 		 1084 aa  57  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  24.7 
 
 		 596 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.02 
 
 		 743 aa  55.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  40.43 
 
 		 858 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.94 
 
 		 719 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  26.4 
 
 		 738 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  42.06 
 
 		 775 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1089 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  25.74 
 
 		 590 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  22.64 
 
 		 701 aa  52  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  26.62 
 
 		 1183 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  26.62 
 
 		 1183 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  25.11 
 
 		 781 aa  50.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  25.32 
 
 		 1183 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  28.33 
 
 		 759 aa  49.7  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  25.32 
 
 		 1183 aa  48.9  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  23.93 
 
 		 582 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  25.32 
 
 		 1183 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  25.32 
 
 		 1183 aa  48.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  28.04 
 
 		 1183 aa  48.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  19.64 
 
 		 997 aa  48.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  32.54 
 
 		 693 aa  48.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3667  hypothetical protein  52.94 
 
 		 191 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  34.31 
 
 		 1136 aa  47.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  34.31 
 
 		 1136 aa  47.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  30.2 
 
 		 605 aa  46.2  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0253  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.72 
 
 		 617 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  27.54 
 
 		 902 aa  45.8  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  23.53 
 
 		 714 aa  45.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  24.55 
 
 		 814 aa  45.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>