55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1576 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1084 aa  2184    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  23.97 
 
 		 1549 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  22.93 
 
 		 1671 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  21.06 
 
 		 1137 aa  96.3  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.42 
 
 		 805 aa  95.9  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2263  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.45 
 
 		 1156 aa  95.1  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1303  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.45 
 
 		 1156 aa  95.1  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1687  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.45 
 
 		 1156 aa  95.1  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.8 
 
 		 1092 aa  90.9  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  28.33 
 
 		 959 aa  90.9  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  28.33 
 
 		 959 aa  90.9  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  21.01 
 
 		 959 aa  82.4  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  22.64 
 
 		 786 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  21.99 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.8 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  21.51 
 
 		 852 aa  78.2  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  21.74 
 
 		 871 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  24.6 
 
 		 762 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  20.58 
 
 		 818 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  21.37 
 
 		 1178 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  20.57 
 
 		 2066 aa  69.3  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  20.57 
 
 		 2066 aa  69.3  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  21.41 
 
 		 1347 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  22.36 
 
 		 1216 aa  66.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  21.22 
 
 		 1347 aa  65.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  39.47 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  21.47 
 
 		 1660 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  21.78 
 
 		 1510 aa  62.4  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  21.78 
 
 		 1510 aa  62.4  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  34.82 
 
 		 919 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  34.62 
 
 		 986 aa  56.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  23.06 
 
 		 1297 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  28.24 
 
 		 1283 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  35.24 
 
 		 920 aa  54.3  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  19.78 
 
 		 725 aa  53.5  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  21.09 
 
 		 874 aa  52.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  20.45 
 
 		 811 aa  52  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  20.45 
 
 		 811 aa  52  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  20.2 
 
 		 726 aa  52  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  38.57 
 
 		 956 aa  52  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  30.91 
 
 		 693 aa  50.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1952  hypothetical protein  36.36 
 
 		 697 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187694 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  21.05 
 
 		 328 aa  51.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1089 aa  50.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  33.75 
 
 		 759 aa  48.9  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  19.69 
 
 		 1120 aa  48.9  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  36.11 
 
 		 993 aa  48.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  27.78 
 
 		 877 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.21 
 
 		 877 aa  47  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  24.84 
 
 		 759 aa  46.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  29.63 
 
 		 1136 aa  46.2  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  29.63 
 
 		 1136 aa  46.2  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  19.21 
 
 		 989 aa  45.8  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  19.21 
 
 		 989 aa  45.8  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1416  hypothetical protein  26.74 
 
 		 565 aa  45.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>