43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1146 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  100 
 
 		 874 aa  1717    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  38.06 
 
 		 737 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  36.84 
 
 		 959 aa  172  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  24.68 
 
 		 1137 aa  134  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0596  prophage LambdaSa1, pblA protein, internal deletion  23.99 
 
 		 670 aa  106  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  23.49 
 
 		 811 aa  105  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  23.49 
 
 		 811 aa  105  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  24.85 
 
 		 716 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  23.03 
 
 		 907 aa  99.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  23.36 
 
 		 726 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  22.43 
 
 		 725 aa  97.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  23.52 
 
 		 721 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  21.82 
 
 		 1510 aa  81.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  21.82 
 
 		 1510 aa  81.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  21.61 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  23.88 
 
 		 792 aa  73.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  21.98 
 
 		 1206 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  21.63 
 
 		 1216 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2837  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1149 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00780437  hitchhiker  0.000194456 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  24.19 
 
 		 989 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  24.19 
 
 		 989 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  21.09 
 
 		 1084 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  22.22 
 
 		 1077 aa  59.3  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  23.66 
 
 		 911 aa  57.8  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  25.13 
 
 		 877 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  21.4 
 
 		 590 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  31.43 
 
 		 969 aa  55.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  26.8 
 
 		 318 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  20.49 
 
 		 1297 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  19.37 
 
 		 1276 aa  51.2  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  26.98 
 
 		 1566 aa  50.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  23.31 
 
 		 1347 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.22 
 
 		 719 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  20.52 
 
 		 738 aa  47.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  27.52 
 
 		 714 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  23.56 
 
 		 759 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  21.37 
 
 		 1347 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  25.83 
 
 		 1346 aa  47.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  24.87 
 
 		 975 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0644  hypothetical protein  23.38 
 
 		 537 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0395132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  20.49 
 
 		 1155 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  20.49 
 
 		 1155 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0287  hypothetical protein  22.03 
 
 		 565 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00035869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>