32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2825 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  78.78 
 
 
806 aa  1216    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  100 
 
 
818 aa  1602    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  52.61 
 
 
852 aa  749    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  39.67 
 
 
762 aa  505  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  27.72 
 
 
871 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  28 
 
 
786 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  25.16 
 
 
759 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0596  prophage LambdaSa1, pblA protein, internal deletion  25.12 
 
 
670 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  34.07 
 
 
647 aa  99.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  24.74 
 
 
807 aa  97.8  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  20.58 
 
 
1084 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  23.2 
 
 
1297 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  28.5 
 
 
841 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  21.09 
 
 
1510 aa  74.7  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  21.09 
 
 
1510 aa  74.7  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  28.02 
 
 
841 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1269  hypothetical protein  25 
 
 
1925 aa  68.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3894  hypothetical protein  24.6 
 
 
1925 aa  67.8  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  26.63 
 
 
1346 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  25.63 
 
 
1283 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  23.41 
 
 
1995 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  24.89 
 
 
737 aa  50.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  20.9 
 
 
907 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  20.43 
 
 
1137 aa  48.5  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  19.46 
 
 
2487 aa  47.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  38.89 
 
 
956 aa  47  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  33.33 
 
 
887 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  28.32 
 
 
759 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  18.99 
 
 
811 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  18.99 
 
 
811 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  22.33 
 
 
693 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  22.81 
 
 
1089 aa  44.3  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>