33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15470 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  100 
 
 
807 aa  1615    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0596  prophage LambdaSa1, pblA protein, internal deletion  38.32 
 
 
670 aa  196  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.76 
 
 
805 aa  150  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  28.76 
 
 
759 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  32.34 
 
 
911 aa  108  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  22.56 
 
 
907 aa  101  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  23.8 
 
 
721 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  35.39 
 
 
647 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  23.82 
 
 
975 aa  99.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  24.32 
 
 
805 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  30.1 
 
 
806 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  29.86 
 
 
818 aa  95.1  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  23.62 
 
 
1297 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  22.82 
 
 
1206 aa  87.8  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  24.88 
 
 
1137 aa  78.2  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  22.86 
 
 
792 aa  62.8  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  26.7 
 
 
989 aa  61.2  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  26.7 
 
 
989 aa  61.2  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  19.64 
 
 
726 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  23.2 
 
 
1510 aa  58.9  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  23.2 
 
 
1510 aa  58.9  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  18.95 
 
 
811 aa  57.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  18.95 
 
 
811 aa  57.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  21.64 
 
 
725 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  22 
 
 
877 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  21.73 
 
 
1070 aa  51.6  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  23.71 
 
 
737 aa  50.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  26.82 
 
 
1311 aa  47.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  26.82 
 
 
1311 aa  47.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  20.93 
 
 
1077 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  26.35 
 
 
716 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  21.07 
 
 
841 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  21.07 
 
 
841 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>