43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1710 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 1995 aa  3956    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  24.67 
 
 		 1155 aa  85.9  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  24.67 
 
 		 1155 aa  85.9  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  22.95 
 
 		 989 aa  84.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  22.95 
 
 		 989 aa  84.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  52.44 
 
 		 194 aa  81.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  49.4 
 
 		 282 aa  79.7  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  34.59 
 
 		 398 aa  70.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2837  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1149 aa  69.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00780437  hitchhiker  0.000194456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  41.24 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  35.9 
 
 		 238 aa  67  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  40 
 
 		 460 aa  66.6  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  44.83 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  41.24 
 
 		 249 aa  65.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  36 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  37.11 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  37.27 
 
 		 231 aa  61.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  32.14 
 
 		 196 aa  61.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  58.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  28.81 
 
 		 863 aa  58.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  36.27 
 
 		 448 aa  58.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  36.45 
 
 		 263 aa  58.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  33.33 
 
 		 239 aa  57  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  35.05 
 
 		 467 aa  57  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  36.08 
 
 		 216 aa  56.6  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  56.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  21.85 
 
 		 1510 aa  56.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  21.85 
 
 		 1510 aa  56.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  36.73 
 
 		 234 aa  55.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  35.05 
 
 		 412 aa  55.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  26.37 
 
 		 852 aa  54.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0593  lipoprotein (VmcD)  22.92 
 
 		 309 aa  52.8  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  23.27 
 
 		 385 aa  50.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  21.84 
 
 		 1311 aa  51.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  21.84 
 
 		 1311 aa  51.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  26.14 
 
 		 570 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  22.89 
 
 		 762 aa  50.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  36.05 
 
 		 445 aa  48.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  38.2 
 
 		 479 aa  48.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  28.12 
 
 		 986 aa  48.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  22.14 
 
 		 907 aa  47.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.31 
 
 		 543 aa  45.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.489984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  22.35 
 
 		 806 aa  45.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>