86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2729 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  100 
 
 
391 aa  772    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  53.62 
 
 
398 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  48.12 
 
 
412 aa  355  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  47.49 
 
 
389 aa  353  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  40.81 
 
 
451 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  47.56 
 
 
359 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  42.8 
 
 
385 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  57.35 
 
 
222 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  69.7 
 
 
467 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  64.42 
 
 
216 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  66.02 
 
 
249 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  71.88 
 
 
225 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  55.64 
 
 
238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  52.82 
 
 
234 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  67 
 
 
272 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  68.75 
 
 
232 aa  143  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  33.64 
 
 
397 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  59 
 
 
209 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  60.4 
 
 
445 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  61.46 
 
 
164 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  57 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  62.64 
 
 
239 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  53.49 
 
 
196 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  34.01 
 
 
400 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  60.75 
 
 
227 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  60.64 
 
 
220 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  60.82 
 
 
145 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  34.71 
 
 
328 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  35.48 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  55.45 
 
 
243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  31.34 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  55.45 
 
 
231 aa  116  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  32.94 
 
 
387 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  31.37 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  56.18 
 
 
258 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  49.04 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  31.39 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  42.86 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  33.79 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  33.47 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  56.98 
 
 
479 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  50.51 
 
 
348 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  34.01 
 
 
479 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  47 
 
 
280 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  40.94 
 
 
499 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  29.86 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  33.21 
 
 
436 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  56.79 
 
 
282 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  33.59 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  32.42 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  27.92 
 
 
401 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  32.87 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  32.87 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  32.87 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  32.34 
 
 
547 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  31.62 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  26.12 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  24.62 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  32.56 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  32.56 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  31.11 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  25.75 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  31.92 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  34 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  27.41 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  32.22 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  34.51 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  48.75 
 
 
194 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  29.52 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  31.44 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  28.25 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  29.95 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  44.83 
 
 
1995 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  23.56 
 
 
343 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  28.95 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  28.3 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  25.71 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  26.92 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  30.59 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  22.28 
 
 
320 aa  53.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  28.79 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  27.07 
 
 
275 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  24.87 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  28.26 
 
 
482 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  19.42 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  25 
 
 
582 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>